La FFME, à travers les Maisons de l'Europe, a pour objectifs de fonder la citoyenneté européenne en expliquant l'idée européenne comme un objet économique, social, politique et culturel, en réfléchissant sur les traits communs qui dessinent un visage à l'Union européenne, en articulant les identités nationales à l'identité européenne, en informant et en formant les citoyens sur les institutions, les politiques, les programmes et les enjeux européens.
La FFME anime et coordonne des actions communes réalisées avec les Maisons adhérentes qui gardent chacune leur originalité et leur total indépendance.
Elle organise des formations régulières des dirigeants et personnels des Maisons. Elle travaille en étroite coopération avec les instances nationales et européennes pour réduire la distance entre les problèmes des citoyens et les questions débattues à l'échelle européenne et donner un sens à la construction européenne pour les citoyens
Elle est associée aux grands dossiers menés par les instances nationales et européennes pour que les Maisons de l'Europe puissent les relayer par des actions sur le terrain (préparation du passage à l'euro, de l'élargissement, élections européennes, constitution...).
